जल निकायों में अवांछनीय पदार्थों के शामिल होने या उनकी उपस्थिति को जल प्रदूषण कहा जाता है। यह तब होता है जब विदेशी पदार्थ जैसे रसायन, घरों से निकलने वाला सीवेज का पानी, उद्योगों से निकलने वाला अपशिष्ट पदार्थ आदि प्रत्यक्ष या अप्रत्यक्ष रूप से जल निकायों में छोड़े जाते हैं। जल के भौतिक, रासायनिक या जैविक गुणों में किसी भी परिवर्तन को जल प्रदूषण कहा जा सकता है।
जल प्रदूषण को बिंदु स्रोत, गैर-बिंदु स्रोत और भूजल प्रदूषण में वर्गीकृत किया जा सकता है।