मेटाबोलाइट चयापचय के दौरान उत्पादित कोई भी पदार्थ है। माइक्रोबियल चयापचय वह साधन है जिसके द्वारा एक सूक्ष्म जीव ऊर्जा और पोषक तत्व प्राप्त करता है, उसे जीवित रहने और प्रजनन करने की आवश्यकता होती है। प्राथमिक मेटाबोलाइट एक प्रकार का मेटाबोलाइट है, जो सीधे सामान्य वृद्धि, विकास और प्रजनन में शामिल होता है। द्वितीयक मेटाबोलाइट्स कार्बनिक यौगिक हैं, जो जीव की सामान्य वृद्धि, विकास और प्रजनन में सीधे तौर पर शामिल नहीं होते हैं।
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