आण्विक जीव विज्ञान के तरीकों में शामिल हैं: 1) कोशिका गणना के लिए हेमासाइटोमीटर, 2) प्रतिबंध एंजाइम डाइजेस्ट (प्रतिबंध एंडोन्यूक्लिअस नामक विशेष एंजाइमों के साथ डीएनए अणुओं को छोटे टुकड़ों में काटने की एक प्रक्रिया), 3) डीएनए बंधाव (डीएनए लिगेज एंजाइम का उपयोग करना जो जुड़ने में मदद करता है) फॉस्फोडिएस्टर बंधन के गठन को उत्प्रेरित करके डीएनए एक साथ जुड़ जाता है), 4) ट्रांसफ़ेक्शन (कोशिकाओं में न्यूक्लिक एसिड को पेश करने की एक प्रक्रिया और मुख्य रूप से यूकेरियोटिक कोशिकाओं में गैर-वायरल तरीकों के लिए उपयोग किया जाता है), 5) वेस्टर्न ब्लॉट (जिसे प्रोटीन इम्युनोब्लॉट भी कहा जाता है) ऊतक समरूपता या अर्क के एक नमूने में विशिष्ट प्रोटीन का पता लगाने के लिए एक विश्लेषणात्मक तकनीक के रूप में और पॉलीपेप्टाइड की लंबाई के अनुसार 3-डी संरचना या विकृत प्रोटीन द्वारा देशी प्रोटीन को अलग करने में जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस का उपयोग करता है), 6) प्लास्मिड शुद्धिकरण (मुख्य रूप से प्लास्मिड डीएनए को अलग करने के लिए उपयोग किया जाता है) आइसोप्रोपेनॉल क्लोरोफॉर्म आदि जैसे विभिन्न अभिकर्मकों का उपयोग करके जीवाणु कोशिकाओं से, 7) एलिसा (एक परीक्षण जो किसी पदार्थ की पहचान करने के लिए एंटीबॉडी और रंग परिवर्तन का उपयोग करता है), 8) इलेक्ट्रोपोरेशन, 9) हीट शॉक विधि, एसडीएस-पेज, डीएनएजेल इलेक्ट्रोफोरेसिस, पीसीआर, पैसेजिंग कोशिकाएं (जो मुख्य रूप से संस्कृति में कोशिकाओं या सूक्ष्मजीवों की संख्या का विस्तार करती हैं) को उपसंस्कृति और आणविक क्लोनिंग भी कहा जाता है।
आण्विक जीवविज्ञान में विधियों के संबंधित जर्नल
आनुवंशिक और आनुवंशिक चिकित्सा, जर्नल ऑफ़ स्टेरॉयड बायोकैमिस्ट्री एंड मॉलिक्यूलर बायोलॉजी, इंटरनेशनल रिव्यू ऑफ़ सेल एंड मॉलिक्यूलर बायोलॉजी, प्रोग्रेस इन बायोफिज़िक्स एंड मॉलिक्यूलर बायोलॉजी, कीट बायोकैमिस्ट्री एंड मॉलिक्यूलर बायोलॉजी, मेथड्स इन मॉलिक्यूलर बायोलॉजी, क्रिटिकल रिव्यूज़ इन बायोकैमिस्ट्री एंड मॉलिक्यूलर बायोलॉजी।