जैविक अणुओं, कोशिकाओं या व्यक्तियों के बीच परस्पर क्रिया से अक्सर ऐसे गुण उभरते हैं जिनकी भविष्यवाणी किसी एक इकाई की विशेषताओं से नहीं की जा सकती। सिस्टम बायोलॉजी जीवित प्रणालियों में ऐसी अंतःक्रियाओं की समृद्धि को मापने का प्रयास करता है। विकासवादी प्रणाली जीवविज्ञान प्राकृतिक चयन द्वारा विकास के माध्यम से बातचीत को बदलने के परिणामों की जांच करके अनुसंधान को एक कदम आगे ले जाता है। गणितीय मॉडल, जनसंख्या आनुवंशिकी और प्रयोग के संयोजन से, विकासवादी प्रणाली जीवविज्ञान अंतःक्रिया उत्पन्न करने वाले कारण संबंधों को निर्धारित करने का प्रयास करता है। हम प्राकृतिक चयन द्वारा विकास के माध्यम से अंतःक्रियाओं को बदलने के परिणामों की जांच करके इस शोध को एक कदम आगे ले जाने में रुचि रखते हैं। हम गणितीय मॉडलिंग, जनसंख्या आनुवंशिकी, आणविक आनुवंशिकी, माइक्रोस्कोपी और प्रयोगात्मक विकास सहित विभिन्न दृष्टिकोणों को जोड़ते हैं। यह तुलनात्मक विश्लेषण से परे है और इसका उद्देश्य विकास की भविष्यवाणी करने के लिए विश्वसनीय यंत्रवत मॉडल प्रदान करना है। मौसम का पूर्वानुमान लगाना बहुत कठिन है, फिर भी कंप्यूटर मॉडल ने काफी मदद की है।
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इंटरनेशनल जर्नल ऑफ स्वार्म इंटेलिजेंस एंड इवोल्यूशनरी कंप्यूटेशन, जर्नल ऑफ प्रोटिओमिक्स एंड बायोइनफॉरमैटिक्स, जर्नल ऑफ फाइलोजेनेटिक्स एंड इवोल्यूशनरी बायोलॉजी, जीनोम इवोल्यूशन एंड इवोल्यूशनरी सिस्टम्स बायोलॉजी, बायोसिस्टम्स, जर्नल ऑफ कंप्यूटर साइंस एंड सिस्टम्स बायोलॉजी, ट्रेंड्स इन इकोलॉजी एंड इवोल्यूशन, इंटरनेशनल जर्नल ऑफ सिस्टमैटिक एंड विकासवादी सूक्ष्म जीव विज्ञान, विकास; इंटरनेशनल जर्नल ऑफ़ ऑर्गेनिक इवोल्यूशन, जर्नल ऑफ़ ह्यूमन इवोल्यूशन।