प्रतिरक्षा प्रणाली एक जीव के भीतर एक जटिल और अत्यधिक विकसित जैविक संरचना और प्रक्रिया है जो आक्रमणकारियों की पहचान करके और उन्हें मारकर बीमारी से बचाती है। यदि कोई व्यक्ति गंभीर रूप से दोषपूर्ण प्रतिरक्षा प्रणाली के साथ पैदा हुआ है, तो वायरस, बैक्टीरिया, कवक या परजीवी के संक्रमण से मृत्यु हो जाएगी। गंभीर संयुक्त इम्युनोडेफिशिएंसी में, एक एंजाइम की कमी का मतलब है कि विषाक्त अपशिष्ट प्रतिरक्षा प्रणाली कोशिकाओं के अंदर बनता है, उन्हें मारता है और इस प्रकार प्रतिरक्षा प्रणाली को नष्ट कर देता है। अधिकांश अन्य प्रतिरक्षा विकार या तो अत्यधिक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया या ऑटोइम्यून हमले के परिणामस्वरूप होते हैं।
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